Bolsista: Alícia Ribeiro Aguiar
Orientador(a): Marcelo Luiz Lima Brandao
Resumo: O objetivo deste projeto foi realizar uma caracterização polifásica de linhagens do complexo Burkholderia cepacia (CBc) isoladas de uma indústria farmacêutica produtora de imunobiológicos. Foram avaliadas 372 linhagens do CBc isoladas no período de 2008 a 2023, de diferentes tipos de amostras coletadas em diversas etapas da cadeia produtiva. Destas, 40 linhagens foram selecionadas para os ensaios: caracterização fenotípica por VITEK(Marca Registrada) 2, caracterização proteômica por MALDI Biotyper(Marca Registrada) , caracterização molecular por sequenciamento completo do gene 16S rRNA, tipificação por MLST, e avaliação das relações genéticas e ocorrência de complexos clonais (CC) nas áreas de produção ao longo do período estudado. As 372 linhagens foram identificadas como pertencentes ao CBc sem distinção de espécie pelo VITEK(Marca Registrada) 2. Foram categorizadas em 51 grupos e 24 singletons, apresentando um total de 286 perfis distintos codificados de I-CCCLXXII, com uma taxa de 1,301 perfil/linhagem. O MALDI-TOF/MS identificou 40 linhagens em nove possíveis espécies: B. cepacia, B. cenocepacia, B. lata, B. metallica, B. pyrrocinia, B. vietnamiensis, B. latens, B. seminalis, e B. stabilis. O sequenciamento completo do gene 16S rRNA apresentou 27 possibilidades de espécies: B. aenigmatica, B. ambifaria, B. anthina, B. cenocepacia, B. cepacia, B. contaminans, B. diffusa, B. dolosa, B. lata, B. metallica, B. multivorans, B. orbicola, B. puraquae, B. pyrrocinia, B. savannae, B. seminalis, B. territorii, B. ubonensis, B. vietnamiensis, B. arboris, B. latens, B. stabilis, B. stagnalis, B. catarinensis, B. pseudomultivorans, B. glumae e B. oklahomensis. Uma linhagem apresentou percentual de identificação < ou = 97,70% (0,13%), sendo considerada com uma possível nova espécie. Após tipificação por MLST, foram descritos quatro novos alelos (1025, 1026, 1027, 1028) para o gene gltB, três (1504, 1505, 1506) para o gene gyrB, dois (955 e 956) para o gene lepA, e um (726 e 920, respectivamente) para os genes phaC e trpB. Até o momento, foi possível identificar os STs 102 (n=5; 12,5%), 762 (n=4; 10%), e 482 (n= 1; 2,5%); e seis novos descritos neste estudo: ST2484 (n= 19; 47,5%), ST2480 (n= 2; 5,0%), ST2482 (n= 2; 5,0%), ST2485 (n= 2; 5,0%), ST2481 (n= 1; 2,5%), e ST2483 (n=1; 2,5%). O gene recA é descrito como um bom marcador na identificação de espécies do gênero Burkholderia. A partir dos resultados deste alelo, todas as linhagens foram identificadas como pertencentes a espécie B. contaminans. Foi possível observar a formação de dois CC. O CC1 formado pelos STs 2484 e 2483, ambos descritos neste estudo; e o CC2 pelos STs 2481 e 482. A maioria das cepas avaliadas foi isolada de amostras de águas, e pode-se observar a maior ocorrência e predominância do ST2484 que foi predominante na indústria no ano de 2023. No presente estudo, o sequenciamento do gene recA possibilitou a identificação das linhagens como pertencentes à espécie B. contaminans. Conclui-se que: 1) a caracterização fenotípica demostrou uma grande diversidade de fenótipos entre as 372 linhagens avaliadas, com uma taxa de 1,301 perfil/linhagem; 2) a caracterização proteômica permitiu a identificação das linhagens a nível de gênero. Quando comparado ao resultado do sequenciamento do gene recA, que identificou todas as linhagens como pertencentes a espécie B. contaminans, todas as amostras teriam sido identificadas de forma errônea em nível de espécie; 3) O sequenciamento do gene 16S rRNA com o objetivo de diferenciar espécies do gênero Burkholderia não forneceu resultados conclusivos; 4) a tipificação por MLST resultado na identificação de nove STs distintos, sendo seis novos descritos neste estudo (ST2480-2485). Estes resultados demonstram que os ambientes de indústria ainda são pouco explorados, e estudos genéticos com essas linhagens e as isoladas de fontes clínicas é importante para avaliar seu potencial patogênico para humanos. Foi possível observar a prevalência do ST2484.