Revista Eletrônica do Programa de Bolsas - Edição 2

Revista: Edição 2 | Ano: 2024 | Corpo Editorial: Editorial | Todas edições: Todas
ISSN: 2966-4020
Análise proteômica e transcriptômica do fungo Sporothrix brasiliensis sob privação e excesso de ferro
Bolsista: PEDRO HENRIQUE CHAVES OTAVIANO
Orientador(a): ROSELY MARIA ZANCOPE OLIVEIRA
Resumo: Fungos causadores de micoses endêmicas infectam humanos por vias inalatória e traumática de propágulos infectantes podendo resultar desde manifestações subclínicas até doença disseminada. A esporotricose está entre as micoses endêmicas mais frequentes no estado do Rio de Janeiro e atualmente é uma doença de notificação compulsória em nosso estado. Sabe-se que o estabelecimento e o sucesso do processo infeccioso estão relacionados com a aquisição de micronutrientes essenciais, como zinco, ferro e cobre, os quais são requeridos como cofatores em vários processos biológicos. No entanto, poucos estudos têm focado na interação de fungos patogênicos com tais nutrientes. O tratamento desta micose em grande parte se limita ao uso de itraconazol e anfotericina B, além da refratariedade de alguns casos e de cepas resistentes. Com isso, pretendemos avaliar a resposta biológica de Sporothrix brasiliensis, estudando as alterações na expressão gênica e proteica de Sporothrix, em condições de privação e excesso de ferro. Para este estudo, o emprego de tecnologias “ômicas”, como o transcriptoma e o proteoma, constitui ferramenta importante para o entendimento dos processos de interação parasito-hospedeiro. Deste modo, esperamos contribuir para um maior conhecimento da biologia do fungo estudado, podendo levar ao desenvolvimento de novas estratégias de diagnóstico, tratamento e controle de uma das principais micoses negligenciadas e endêmicas no estado do Rio de Janeiro.
BIODIVERSIDADE DE MONOGENOIDEA (PLATYHELMINTHES) PARASITOS DE PEIXES EM DUAS BACIAS HIDROGRÁFICAS DO BRASIL: ABORDAGENS MORFOLÓGICAS E MOLECULARES
Bolsista: JULIA RIBEIRO FONTES
Orientador(a): Simone Chinicz Cohen
Resumo: O nível de impacto sobre a diversidade de peixes devido a intensa ação do homem que destrói o habitat, introduz espécies exóticas e provoca alterações ambientais mudando o percurso natural das águas. O stress provocado nos peixes em consequência dos processos de degradação ambiental pode contribuir para o aumento do número de espécies parasitas com ciclo de vida direto como os Monogenoidea, provocando grandes danos à população de peixes. Os Monogenoidea são parasitos de peixes, encontrados principalmente nas brânquias, que apresentam ciclo de vida direto, alta diversidade de espécies e uma grande especificidade de hospedeiro. A taxonomia e sistemática sustentam todas as pesquisas em ecologia e evolução, bem como áreas de ciências aplicadas, como pesca e aquicultura, sendo necessário descobrir os parasitos e caracteriza-los corretamente. Considerando essas premissas, o objetivo do projeto é o estudo da diversidade de Monogenoidea parasitos de peixes provenientes de duas bacias hidrográficas brasileiras, rio Tocantins, estado do Maranhão e rio Juruá, estado do Acre. Serão avaliados exemplares de diferentes espécies obtidos nessas localidades para coleta dos parasitos. A presença dos parasitos pode comprometer a vitalidade dos peixes ou pode ameaçar o valor de venda dos mesmos pelos pescadores. Em águas naturais, há um equilíbrio entre a população hospedeira e a parasita, mas em condições de piscicultura intensiva, esses helmintos podem causar grandes danos aos peixes ou mesmo levá-los à morte, já que induzem à uma excessiva produção de muco nos filamentos branquiais, diminuindo sensivelmente as taxas respiratórias e de crescimento, podendo até afetar seus processos reprodutivos. O advento do sequenciamento de DNA proporcio¬nou, nas últimas décadas, a criação de bancos de dados genéticos visando reunir e disponibilizar, gratuitamente, informações genéticas de táxons do mundo todo. Essas coleções de sequências de DNA têm contribuído para a realização de pesquisas em diversas áreas, dentre elas taxonomia, sistemática, biologia da conservação e ecologia. Nas últimas décadas, o uso de ferramentas moleculares para identificação de espécies deu origem a uma nova linha de pesquisa em biologia, a taxonomia molecular. Os estudos moleculares têm mostrado ser uteis como critérios diagnósticos para os parasitos Monogenoidea e para reconhecer espécies similares geneticamente detectadas. Os estudos de taxonomia integrativa, propõem a utilização combinada de diferentes abordagens para reconhecer e delimitar espécies e dentro desse contexto, qualquer informação que contribua para esse objetivo é considerada de grande utilidade para a taxonomia. Foram examinados exemplares de peixes provenientes do rio Tocantins, estado do Maranhão e rio Juruá, estado do Acre. A captura foi realizada por equipes parceiras nessas localidades. Os peixes capturados foram levados para o laboratório para serem examinados e registrados os dados biométricos. As brânquias foram removidas e fixadas em álcool 70% e serão examinadas posteriormente para coleta dos parasitos. No Laboratório de Helmintos Parasitos de Peixes (LHPP), do Instituto Oswaldo Cruz, no Rio de Janeiro, os filamentos branquiais serão raspados e os Monogenoidea serão coletados e processados para o estudo, com montagem em lâminas, que serão depositadas em coleções especializadas. Os espécimes serão estudados em microscópio de luz, ilustrados com auxílio de um tubo de desenho acoplado ao microscópio e medidos com ocular micrométrica. Parte do material terá o DNA genômico extraído, sua concentração mensurada por espectrofotometria e as amplificações das regiões do gene serão realizadas por meio da reação em cadeia de polimerase (PCR). As reações de ciclo do sequenciamento serão realizadas e o sequenciamento será executado na Plataforma de Sequenciamento de DNA, na rede de plataformas tecnológicas do Instituto Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, Rio de Janeiro, RJ. As sequencias geradas serão analisadas e editadas com programas específicos e o alinhamento e obtenção da sequência consenso será comparada com as depositadas no GenBank, realizando a análise de similaridade e serão identificadas utilizando ferramentas disponíveis na internet.
Investigação do envolvimento da neuroinflamação do microambiente tumoral na progressão de glioblastoma em modelo in vivo
Bolsista: LAYS LIRA DE OLIVEIRA
Orientador(a): ANDRESSA BERNARDI
Resumo: Os glioblastomas (GBMs) são os tumores primários mais comuns e agressivos dentre os tumores cerebrais, com baixa sobrevida minimamente prolongada pelo tratamento padrão, que inclui cirurgia para ressecção tumoral, radioterapia e quimioterapia pós-operatória. O desenvolvimento de novas estratégias terapêuticas é uma das principais dificuldades devido ao mau prognóstico, às terapias ineficientes e à recorrência associada a estes tumores. Neste contexto, recentes evidências indicam que os GBMs têm na sua composição também células não neoplásicas (microglia e macrófagos associados ao tumor - TAMs), que podem facilitar a proliferação, a sobrevivência e a migração das células tumorais. Atualmente acredita-se que estas células têm papel fundamental na regulação da neuroinflamação, sugerindo o seu envolvimento na progressão tumoral e na resposta ao tratamento. Desta forma, o presente projeto tem como objetivo avaliar como a neuroinflamação presente no microambiente tumoral pode interferir na progressão dos GBMs. O modelo in vivo de GBM será induzido pelo implante, através de cirurgia estereotáxica, de células de glioma da linhagem GL261 no striatum de camundongos C57BL/6. Para investigar como a modulação do microambiente tumoral através da microglia/TAMs pode interferir na progressão e na malignidade do GBM, os animais serão tratados com minociclina ou PLX5622. Serão avaliados parâmetros de crescimento tumoral, características histopatológicas de malignidade e a sobrevida dos animais. Através da técnica de imunohistoquímica serão avaliados o índice mitótico e a angiogênese, bem como marcadores de ativação microglial, astrogliose reativa, diferenciação celular e marcadores de células-tronco tumorais. Algumas vias de sinalização (MAPK, AKT/PI3K, Wnt/Beta-catenina, STAT-6) serão avaliadas por Western blotting. Considerando ausência de alternativas terapêuticas eficazes para o tratamento desses tumores, a execução deste projeto poderá contribuir para a compreensão de como o microambiente pode interferir na malignidade dos GBMs.
PANORAMA DA QUEDA DE COBERTURA VACINAL INFANTIL: ASSOCIAÇÃO TEMPORAL COM AS INCIDÊNCIAS DE DOENÇAS IMUNOPREVENÍVEIS E FATORES ASSOCIADOS COM A HETEROGENEIDADE ESPACIAL NAS CAPITAIS BRASILEIRAS E MUNICÍPIOS DE MINAS GERAIS
Bolsista: ISABEL SILVA MITRAUD RUAS
Orientador(a): Taynana Cesar Simoes
Resumo: JUSTIFICATIVA E RELEVÂNCIA O Brasil vem mostrando queda importante da cobertura vacinal dos imunobiológicos contemplados no calendário básico infantil, que pode impactar negativamente na Saúde Pública do país, levando ao retorno e fortalecimento de doenças imunopreveníveis de importante impacto na morbimortalidade de crianças. O Programa Nacional de Imunizações (PNI) coordena as ações de imunização no Brasil. Embora o programa venha tendo alto desempenho e sucesso ao longo dos anos, com diminuição e erradicação de algumas doenças importantes como sarampo, poliomielite e tétano neonatal, tem-se verificado quedas progressivas das coberturas vacinais do calendário básico infantil desde 2011. Esta queda da cobertura é multifatorial, podendo estar associada ao próprio sucesso do PNI, uma vez que a população atualmente não convive com as mazelas das doenças imunopreveníveis como antigamente, deixando de valorizar a vacinação precoce e rotineira como ferramenta importante da manutenção da situação epidemiológica de controle; devido a movimentos antivacinas, que minimizam os benefícios da vacinação e maximizam os riscos e efeitos adversos; à deficiência de oferta e à falta de operacionalização da vacinação em outros ambientes como escolas, universidades, locais de trabalho; convivência de dois sistemas de informação, um que registra as doses aplicadas e outro que registra crianças vacinadas, entre outros fatores. Resultados preliminares do estudo proposto mostraram quedas significativas nas coberturas vacinais por todos os imunobiológicos do calendário básico infantil oferecidos pelo SUS. Na maioria dos casos, a cobertura esteve abaixo da meta mínima preconizada pelo Ministério da Saúde. No entanto, esta queda ocorre de forma desigual no tempo e nos territórios. Em todo o país, foi observada queda percentual de 46,3% para a BCG e de 43,5% para o reforço de Poliomielite, entre 2010 a 2021. Todas as vacinas estiveram abaixo da cobertura mínima preconizada pelo Ministério da Saúde, verificando-se uma diferença percentual em relação a meta preconizada, variando de 10,5% para o reforço da tríplice bacteriana (contra difteria, tétano e coqueluche) a 45,6% para o reforço de Poliomielite. Algumas vacinas, embora tenham apresentado menor queda percentual no período, como a vacina contra Hepatite A com queda de 4,5% entre 2010 e 2021, apresentaram grandes diferenças percentuais em relação à cobertura mínima preconizada (Hepatite A = -39,4%). O indicador proposto permitiu trabalhar com modelos estatísticos para dados de contagem, sem a necessidade de aproximações ou transformações na variável original de cobertura vacinal, tendo uma estimativa do tipo razão como medida de efeito estimado e, portanto, de mais fácil interpretação epidemiológica. Houve queda importante da cobertura para todos os imunobiológicos do calendário básico infantil oferecidos pelo SUS a partir de 2015, e na maioria, abaixo da cobertura mínima preconizada pelo MS. Esta queda não ocorre da mesma maneira no território brasileiro, sendo maior nas capitais das regiões Norte e Nordeste nos anos mais recentes, em particular, anos pós-pandemia de COVID-19. Pretende-se dar continuidade ao trabalho de descrição e análise de cobertura vacinal infantil, caracterizando sua distribuição ao longo do tempo, e avaliando a mudança na distribuição espacial da cobertura no período de 2010 a 2020 entre as capitais brasileiras e nos municípios de Minas Gerais. Objetiva-se também avaliar as associações no espaço e tempo das coberturas vacinais com as incidências das doenças imunopreveníveis correspondentes, bem como a influência de fatores socioeconômicos e de acesso à saúde na heterogeneidade espacial das coberturas. OBJETIVOS: Objetivo Geral: Avaliar heterogeneidades espaciais e temporais das coberturas vacinais infantis e as associações com as incidências das doenças imunopreveníveis correspondentes, bem como a influência de fatores socioeconômicos e de acesso à saúde nas capitais brasileiras e nos municípios de Minas Gerais. Objetivos específicos: 1) Avaliar as distribuições temporais e espaciais das coberturas vacinais nas capitais brasileiras e nos municípios de Minas Gerais. 2) Avaliar as associações das séries temporais das coberturas vacinais e doses aplicadas relativas a BCG, hepatite B, poliomielite, pentavalente, rotavírus humano, febre amarela, meningococo conjugada C, pneumococo conjugado 10 valente, influenza, hepatite A, tríplice viral, varicela, reforço para DPT e poliomielite com as incidências das doenças imunopreveníveis relacionadas. Deve-se considerar defasagens temporais nessas associações, bem como interações do tempo com a macrorregião de residência; 3) Avaliar as associações espaciais entre as coberturas vacinais relativas aos imunobiológicos supracitados e as incidências das doenças imunopreveníveis relacionadas no último ano de análise; 4) Avaliar possíveis fatores socioeconômicos e de acesso à saúde relacionados com a heterogeneidade espacial das coberturas vacinais, em momentos de disponibilidade de dados. METODOLOGIA Tipo de Estudo e Fonte de dados Trata-se de um estudo ecológico de análise de séries temporais e distribuição espacial da cobertura vacinal infantil nas capitais brasileiras e nos municípios de Minas Gerais no período de 2010 a 2020, avaliando possíveis associações com as incidências das doenças relacionadas, além de fatores socioeconômicos e de acesso à saúde. A população de estudo é formada por crianças de até 1 ano de idade. O Sistema de Informações do Plano Nacional de Imunizações (SI-PNI) é formado por um conjunto de sistemas, dentre os quais, a Avaliação do Programa de Imunizações (API), que registra, por faixa etária, as doses de imunobiológicos aplicadas e calcula a cobertura vacinal, por unidade básica de Saúde, município, regional da Secretaria Estadual de Saúde, estado e país. Fornece informações sobre rotina e campanhas, taxa de abandono e envio de boletins de imunização (SI-PNI). Os dados de cobertura vacinal e número de doses aplicadas são coletados e tratados, para avaliação das tendências temporais e distribuição espacial ao longo do tempo entre as capitais brasileiras e os municípios de Minas Gerais. Esses dados são extraídos do Departamento de Informática do SUS – DATASUS (http://sipni.datasus.gov.br/si-pni-web/faces/inicio.jsf), para os imunobiológicos BCG, hepatite B, poliomielite, pentavalente, rotavírus humano, febre amarela, meningococo conjugada C, pneumococo conjugado 10, valente, influenza, hepatite A, tríplice viral, varicela e reforço para DPT e poliomielite. Os casos incidentes das doenças relacionadas aos imunobiológicos considerados foram obtidos do DATASUS (Sistema de Informação de Agravos de Notificação – SINAN, bem como outras informações epidemiológicas e de morbidade (https://datasus.saude.gov.br/informacoes-de-saude-tabnet/). Os arquivos geográficos (shapefiles) para mapeamento da cobertura vacinal são obtidos pelo IBGE. Dados populacionais e variáveis socioeconômicas devem ser obtidas também através do CENSO2010 (2021 se disponível. Dados de nascidos vivos serão obtidos do Sistema de Informações sobre Nascidos Vivos – SINASC (http://tabnet.datasus.gov.br/cgi/deftohtm.exe?sinasc/cnv/nvbr.def ). Além disso, propõe-se avaliar outros indicadores socioeconômicos e de acesso à saúde. Por exemplo, as variáveis do índice da Federação da Indústria do Estado do Rio de Janeiro (FIRJAN) de desenvolvimento municipal (IFDM) de abrangência nacional, com ano-base de 2016. Alguns indicadores de cada dimensão são: IFDM Emprego e Renda, IFDM Educação, IFDM Saúde. O IFDM usa como referência para o acompanhamento do desenvolvimento socioeconômico as estatísticas públicas oficiais disponibilizadas através do Ministério do Trabalho e Emprego, Ministério da Educação e Ministério da Saúde, sendo composto por três áreas de avaliação: Emprego e Renda, Educação e Saúde. Na interpretação do índice, com variação de valores partido do mínimo, com valor 0, até o valor máximo, correspondendo ao valor 1. Quanto mais próximo estão os valores do IFDM do valor 1, maior a representação de desenvolvimento da localidade, permitindo a comparação da evolução do índice ao longo nos anos (https://www.firjan.com.br/pagina-inicial.htm). Outros indicadores que forem considerados relevantes ao longo do processo serão avaliados com base em outras fontes de dados de saúde, incluindo inquéritos domiciliares. Quanto à análise estatística, inicialmente os indicadores serão descritos através de medidas resumo e análise gráfica, seguido de análise de tendência temporal e mapeamento das incidências e indicadores socioeconômicos e de acesso à saúde. Posteriormente as associações temporais entre cobertura vacinal e os indicadores propostos serão avaliadas desde medidas de associação mais simples, como o Coeficiente de Correlação de Spearman, à associações entre séries temporais através de modelos estatísticos, como os Modelos Aditivos Generalizados (GAM). Serão ainda avaliadas defasagens temporais entre as séries, através do método de defasagens distribuídas. As associações espaciais dos indicadores propostos com a cobertura vacinal serão avaliadas através de Índices de Moran uni e Bivariado. As análises serão todas feitas em softwares livres, como o software estatístico R para as análises estatísticas e os softwares QGis e GeoDa para a manipulação de dados geográficos e algumas análises espaciais.
Modelagem e script de Banco de Dados para os dashboards de integração de informações via gráficos de bechmarking.
Bolsista: LEVI MENA BARRETO MESQUITA
Orientador(a): Galba Freire Moita
Resumo: Um estudo científico recente (Ramos, 2016) estudou a eficiência comparada de unidades da APS em quatro relevantes capitais brasileiras entre 2009 a 2014 e identificou que as unidades sob gestão própria das prefeituras são mais eficientes que as gerenciadas por OSs. O plano de trabalho inicial tinha como objetivo desenvolver uma plataforma virtual (aplicativo on-line) de Avaliação de Qualidade, Satisfação de Usuários e Desempenho de Equipes, para Decisão em Saúde. O desafio tecnológico é desenvolver uma plataforma on-line responsiva (adaptável a qualquer equipamento) visando a geração de gráficos pautados em Business Intelligence (BI) para subsidiar a tomada de decisão dos gestores da saúde. As principais atividades podem ser sintetizadas no objetivo geral do projeto, a saber: Desenvolver uma plataforma virtual (aplicativo on-line) de Avaliação de Qualidade, Satisfação de Usuários e Desempenho de Equipes, para Decisão em Saúde, por aplicação de pesquisa automatizada com usuários, gráficos dinâmicos de benchmarking, conforme abaixo: As principais atividades podem ser sintetizadas no objetivo geral do projeto, a saber: Desenvolver uma plataforma virtual (aplicativo on-line) de geração de acesso ao painel de Indicadores de Eficiência, Efetividade e Qualidade, gráficos dinâmicos de benchmarking, conforme abaixo: - Utilização do conhecimento de Excel avançado, como por exemplo: Tabelas dinâmicas, gráficos, listas encadeadas e fórmulas de relacionamento entre tabelas. Portanto, com tais artifícios, criar relatórios e tabelas a fim de cumprimento dos requisitos do projeto. - Relacionar e conectar informações em tabelas e arquivos diferentes para uma melhor eficiência no manuseio dos dados. - Desenvolver e formatar bancos de dados, sobretudo em Excel, para o desenvolvimento de relatórios gráfico-dinâmicos em Power-Bi. - Desenvolver modelos padronizados pelo estabelecimento de padrões analíticos dos gráficos de bechmarking e do painel de dashboard, para a geração de relatórios executivos para apoio à tomada de decisão de gestores e analistas técnicos. REFERÊNCIAS - Edital Fiocruz Brazil Acceleration Fund - II – Projeto “The impact of service management models on efficiency and effectiveness indicators in primary care in urban areas of Brazil’s Northeast (pilot project)”. - Edital Funcap nº 05/2021 PROGRAMA INOVAFIT - Projeto “QualitySaúde - Plataforma Web (Aplicativo on-line) de Avaliação de Qualidade, Satisfação de Usuários e Desempenho de Equipes, com Gráficos e Alertas para Decisão em Saúde”.
Caracterização de alterações em genes associados a menor susceptibilidade de Giardia lamblia ao metronidazol
Bolsista: ANA VITORIA SILVA COSTA
Orientador(a): MARIA FANTINATTI FERNANDES DA SILVA
Resumo: Giardia lamblia é um protozoário intestinal capaz de infectar um amplo espectro de hospedeiros mamíferos. Esta infecção é capaz de apresentar uma grande variedade de quadros clínicos de assintomático à sintomáticos agudos ou crônicos, sendo a diarreia a principal manifestação. Para o tratamento da giardíase o principal fármaco utilizado é o metronidazol da classe dos nitroimidazóis. Esta infecção possui distribuição global e as taxas de prevalência podem ser superiores a 50% em áreas de vulnerabilidade social e sanitária. Nestas áreas, elevados índices de reinfecção podem ser observados e levam ao uso indiscriminado de drogas o que aliado a baixa oferta de classes de fármacos para o tratamento da giardíase podem favorecer a emergência de cepas resistentes. Entretanto, os mecanismos envolvidos no processo de resistência parasitária são desconhecidos. Neste contexto, o projeto tem como objetivo investigar alterações em genes com diferença na abundância de proteínas envolvidas na redução de susceptibilidade de G. lamblia ao metronidazol. Partiremos de resultados de uma análise proteômica, na qual foram identificas 921 proteínas com diferença na sua abundância e a partir destes dados vamos: 1) Determinar in vitro genes envolvidos no processo de menor susceptibilidade ao metronidazol. Será utilizada a qPCR para análise da expressão gênica e o sequenciamento gênico para identificar alterações nucleotídicas em genes que codificam as proteínas que diferem na abundância; 2) Estabelecer um ou mais alvos gênicos para diferenciar cepas susceptíveis de cepas resistentes através PCR em tempo real com high-resolution melting. O conjunto destes resultados permitirão traçar mecanismos alternativos de tratamento e estabelecer novos racionais para estratégias de controle giardíase.
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