Revista Eletrônica do Programa de Bolsas - Edição ZERO

Revista: Edição ZERO | Ano: 2022 | Corpo Editorial: Editorial | Todas edições: Todas
ISSN: 2966-4020
Padronização de metodologia de genotipagem em tempo real para o diagnóstico da malária: identificação de zoonose em áreas de Mata Atlântica Fluminense
Bolsista: Roberta Pittas
Orientador(a): Natália Ketrin Almeida de Oliveira MOCELIN
Resumo: O Plasmodium vivax é o parasito predominante no Brasil, onde representa um grande problema de saúde pública, respondendo por 90% dos casos de malária. Embora no país o fardo da malária na região de Mata Atlântica (MA) seja consideravelmente menor do que na Amazônia Legal, a singularidade da transmissão nesta região, caracterizada como uma zoonose atribuída ao P. simium - parasito de primatas não-humanos, impõe novos desafios para a eliminação da endemia e pode ser o epicentro do possível surgimento de uma 7ª espécie de Plasmodium a estabelecer infecção no homem e, por isso, deve ser prontamente e precisamente diagnosticado. Os avanços nas tecnologias genômicas permitem o desenvolvimento de técnicas de diagnóstico e o acesso a um conjunto de dados mais aprimorados e criam oportunidades para fornecer informações sobre a origem da infecção e transmissão dos parasitos da malária que auxiliam o Programa Nacional de Controle da Malária a responder questões epidemiológicas importantes e a construir melhores estratégias de controle. Até a atualidade, a diferença entre o P. vivax cosmopolita e o P. simium são 2 nucleotídeos no DNA mitocondrial. No entanto, o único método descrito para diferenciar as espécies causadoras de infecção em humanos na MA se baseia em ensaio nested-PCR RFLP, que requer 2 reações de PCR seguida por digestão enzimática do produto e confecção de gel de agarose corado com brometo de etídeo. Esta técnica leva pelo menos 6 horas para obtenção de resultados, é realizada em um sistema aberto e, portanto, mais sujeito a contaminação, além de não se conhecer a sua precisão, que compreende os parâmetros de repetibilidade e reprodutibilidade. Ademais, os locais de reconhecimento destas enzimas são geralmente 4 a 6 pares de comprimento e por isso são menos restritas que uma sonda ou primer específicos, podendo haver o reconhecimento de regiões inespecíficas. Por isso, o ensaio que pretendemos desenvolver é uma genotipagem em tempo real através da técnica de real time PCR que é de simples execução, rápida e robusta, que consiste num sistema fechado sem manipulação pós-amplificação minimizando, portanto, o risco de contaminação e não necessita de géis de agarose para a leitura dos resultados, o que otimiza ainda mais o tempo de execução, que é de cerca de 1 hora, e evita a manipulação de agentes cancerígenos. Este ensaio permitirá ao CPD-Mal, único Centro de Referência da Malária na Extra-Amazônia, o acompanhamento dos casos oriundos de áreas de MA e ao longo do tempo gerará informações sobre a transmissão e avaliação das intervenções e, assim, complementar a vigilância malariométrica convencional. Nesse contexto, nos propomos a desenvolver um ensaio de genotipagem em tempo real para diferenciar P. vivax cosmopolita de P. simium para a demonstração da transmissão zoonótica de P. simium infectando seres humanos. A padronização do ensaio de PCR em tempo real, vai considerar conceitos e experimentos referenciados e adotados pelo Food and Drug Administration, EUA. O checklist incluem a otimização dos primers e o desenho da sonda, suas titulações, para estabelecimento das melhores concentrações de uso, o estabelecimento do limite de detecção, a sensibilidade analítica e a precisão. Testaremos 2 sistemas de PCR em tempo real, o sistema TaqMan que usa sondas MGB específicas para os alelos e; o sistema High Resolution Melting (HRM) que usa um corante fluorescente inespecífico dupla-fita de DNA, esse método é feito adicionando uma ciclagem pós-PCR que desnatura as fitas com alta resolução, a diferença na temperatura de desnaturação “melting” das fitas é capaz de identificar variações mínimas nas sequências de DNA. O protocolo desta pesquisa foi submetido e aprovado pelo CEP/IOC/Fiocruz sob o número CAAE 88554718.0.3002.5248.
VARIANTES DE PREOCUPAÇÃO DA COVID-19: ESTUDO SOBRE O PERFIL DOS PACIENTES PORTADORES DA LINHAGEM GAMA (P.1) NO ESTADO DO CEARÁ, BRASIL.
Bolsista: BARBARA NEPOMUCENO GUIMARAES
Orientador(a): Fernando Braga Stehling Dias
Resumo: Surgida no final de 2019 na cidade de Wuhan, China, a Covid-19 se disseminou de forma assustadora em todo o planeta. Novos hábitos de vida surgiram no mundo inteiro: a máscara facial tornou-se acessório obrigatório e o álcool em gel virou um item indispensável para todos. Aprendemos o significado da palavra lockdown e o medo de desenvolver Síndrome Respiratória Aguda Grave tomou conta das pessoas. Assim como ocorre com outros vírus de RNA, o SARS-CoV-2 também sofreu diversas mutações originando as chamadas variantes de preocupação (VOC), com destaque para uma linhagem brasileira chamada P.1, identificada pela primeira vez em Manaus, Amazonas. Esta linhagem foi considerada bem mais transmissível, o que certamente contribuiu para uma explosão de novos casos e o aumento do número de óbitos na segunda onda da doença no Brasil. Assim, o presente projeto tem como objetivo avaliar o perfil de pessoas infectadas com a VOC Gama (P.1) da Covid-19 no estado do Ceará, Brasil. Foram utilizados dados gerados por meio de sequenciamento genômico obtidos pela Rede de Vigilância Genômica da Fiocruz Ceará. Os resultados preliminares indicaram que, até o momento, das mais de 5.100 amostras foram sequenciadas, cerca de 1/3 (n=1.859) correspondem à VOC Gama. Dos pacientes com infectados com a VOC Gama, a distribuição entre os sexos foi semelhante com pequena predominância no sexo feminino (53,4%). Todas as faixas etárias foram infectadas, sendo mais da metade dos infectados correspondente aos adultos de 20-49 anos (54,04%). Dentre as 1.859 pessoas identificadas com a VOC Gama, 41,8% (n=777) são residentes da região metropolitana de Fortaleza. Esses dados preliminares ainda serão analisados de forma mais robusta, incluindo análises estatísticas apropriadas. Além disso, como continuidade do presente projeto, será determinada a carga viral dos pacientes portadores da VOC Gama no estado do Ceará.
Informação e desinformação em um contexto pandêmico: avaliação da acurácia do conteúdo circulado em uma comunidade on-line sobre COVID-19
Bolsista: MARIANE AMARAL PEREIRA
Orientador(a): LETICIA TEREZA BARBOSA DA SILVA
Resumo: Indivíduos recorrem cada vez mais à internet para conhecer mais sobre seu quadro de saúde. As comunidades on-line de saúde (COS) têm se destacado enquanto um dos principais ambientes para obter informação sobre saúde1. Nesse cenário, a qualidade do conteúdo circulado nas COS torna-se uma questão importante. Informação incompleta, incorreta e incompreensível pode ser disponibilizada, possivelmente prejudicando o bem estar e a tomada de decisão dos indivíduos2. Na pandemia de COVID-19, há um grande nível de desinformação sobre a nova doença3. Nesse cenário, este projeto busca analisar a seguinte questão: qual é o grau de acurácia das informações que circulam em uma comunidade on-line sobre COVID-19? Ele possui cinco objetivos: 1) realizar levantamento bibliográfico sobre qualidade da informação em COS; 2) coletar e sistematizar as publicações e comentários da COS; 3) identificar os principais temas sobre COVID-19 debatidos; 4) construir ferramenta de avaliação da acurácia; 5) realizar a avaliação da acurácia do conteúdo, a partir das evidências mais adequadas disponíveis. A realização deste projeto justifica-se devido à importância do debate sobre a acurácia da informação on-line sobre COVID-19. Ao longo da pandemia, foram disseminadas inúmeras notícias falsas, que podem trazer graves consequências3. Assim, a avaliação da informação circulada em uma COS possibilitará identificar o nível de desinformação ao qual os participantes estão expostos. Os resultados podem prover subsídios para o enfrentamento da circulação de informação falsa, além de estratégias que garantam o acesso à informação on-line de qualidade sobre COVID-19 e possam contribuir de modo positivo para o itinerário terapêutico dos indivíduos. A relevância deste projeto reside no método de avaliação adotado. Para Paolucci4 indica o uso de sistemas de informações clínicas, uma vez que agregam de modo conciso as evidências mais relevantes e adequadas4. Até o momento, não há estudos de avaliação da qualidade da informação on-line sobre COVID-19 que adotem este método. Nesse sentido, ao realizar a avaliação da acurácia baseada nas mais atuais e adequadas evidências, este projeto traz uma inovação para o campo da avaliação da informação on-line sobre saúde. A relevância também reside no fato de que ainda não há estudos voltados especificamente para avaliação da acurácia da informação circulada em COS. Em relação à metodologia, a primeira etapa da pesquisa consistirá na realização de um levantamento bibliográfico sobre qualidade da informação em COS, a fim de sistematizar a produção sobre o tema. Em seguida, será feita a coleta das postagens e comentários publicados em uma COS sobre COVID-19 durante o período de três meses. Na sequência, será realizada uma análise temática5, a fim de mapear os principais temas sobre COVID-19 debatidos no grupo. Posteriormente, será construída uma ferramenta para avaliar a acurácia da informação on-line sobre a doença. A fase final consistirá na avaliação da acurácia do conteúdo coletado na COS, utilizando como referência as evidências disponíveis na plataforma Dynamed Plus, que filtra a literatura médica científica a fim de identificar informação clinicamente relevante, atualizada e baseada em evidências.
INVESTIGAÇÃO DA ATIVIDADE ANTIPARASITÁRIA E IMUNOMODULADORA DE CANDIDATOS A FÁRMACOS ANTICHAGÁSICOS
Bolsista: Daniele Santana de Sousa Oliveira
Orientador(a): Valéria Pereira Hernandes
Resumo: A Doença de Chagas é um grave problema de saúde pública no Brasil, sendo considerada, ainda, negligenciada e endêmica. Atualmente, considerando que o uso de Nifurtimox no Brasil não é permitido, seu tratamento é realizado apenas com Benzonidazol, que, no entanto, apresenta muitas limitações, expondo a necessidade de desenvolvimento de novas terapias (SILVA, 2018). Usada como ferramenta para o planejamento de fármacos, a hibridização molecular tem consiste em incorporar, na mesma estrutura química, dois farmacóforos reconhecidamente bioativos em determinados alvos, com vistas a obter sinergismo, redução da toxicidade, além de outros efeitos benéficos. Recentemente, o Laboratório de Síntese Orgânica Aplicada a Fármacos do Departamento de Ciências Farmacêuticas-UFPE, sob a coordenação do Prof. Dr. Antônio Rodolfo de Faria, desenvolveu uma série de híbridos contendo núcleos 2-isoxazolina e tiazol, para avaliação de seu potencial antitripanossoma e antileishmania. Submetidos a ensaios tripanossomicidas in vitro, compostos da série sintetizada se mostraram altamente ativos e seletivos, sendo, então, selecionados para ensaios in vivo em camundongos como modelos experimentais.
ENCAPSULAMENTO DE siRNAs EM NANOPARTÍCULAS LIPÍDICAS PARA INTERFERÊNCIA DA EXPRESSÃO DA PROTEÍNA-S DE SARS-CoV-2
Bolsista: FRANCISCO DANTAS LOURENCO
Orientador(a): ROBERTO NICOLETE
Resumo: A pandemia da COVID-19 mobilizou o desenvolvimento de terapias para tratar a doença, cuja principal forma de transmissão é a respiratória. Sabe-se que a Proteína Spike (Proteína-S) é a responsável pela entrada do vírus nas células, utilizando o receptor da Angiotensina 2 (ACE2) para isso. Foi demonstrado que o SARS-CoV poderia ser inibido em células vero através da utilização da técnica de RNA de interferência (RNAi). Além disso, foi evidenciado que o tratamento com pequenos RNAs de interferência (siRNAs) direcionados ao genoma viral apresentou 80% na inibição do SARS-CoV. Logo, é encorajador investir no desenvolvimento de fármacos para inibir a expressão do RNA mensageiro (RNAm) da Proteína-S, causando a redução dela. Embora a vacinação seja geralmente o mecanismo mais utilizado para combater infecções virais, terapias alternativas por RNAi já demonstraram resultados animadores e diversas empresas farmacêuticas já notaram o potencial de tratamentos para COVID-19 utilizando siRNA. Surge o questionamento de como realizar esse procedimento pois os siRNA se degradam facilmente na corrente sanguínea e, pela hidrofilicidade, têm dificuldades para entrarem nas células. O medicamento Patisiran (ONPATTRO) utiliza siRNAs formuladas com Nano partículas lipídicas – LNPs para agir no gene transtirretina (TTR) em células do fígado. Casos graves têm inclinação para cargas virais altas e uma carga viral mínima é necessária para dar origem ao processo infeccioso do SARS-CoV-2. Logo, utilizar o silenciamento gênico para reduzir a expressão do RNAm da Proteína-S pode ser uma maneira promissora para tratar a infecção e/ou impedir seu agravamento, visto a importância dessa proteína para replicação do vírus. O objetivo desse estudo é construir siRNAs que possam ser nanoencapsulados e que tenham como alvo a parte conservada da Proteína-S do SARS-CoV-2. Para isso, regiões conservadas da Proteína-S serão selecionadas baseadas em genomas circulantes no Brasil. Ainda, siRNAs serão racionalmente desenhados e construídos sinteticamente para silenciar esta região do genoma viral e que não cause interferência em genes humanos. Após, os siRNAs selecionados serão encapsulados em nanopartículas lipídicas (LNPs) e essas serão caracterizadas fisicoquimicamente quanto ao tamanho, potencial zeta, concentração e eficiência de encapsulamento.
ESTUDO IN SILICO DO MECANISMO DE INIBIÇÃO DA ENZIMA NS5 DO VÍRUS ZIKA MEDIADO PELO METABÓLITO ATIVO E FORMAS TAUTOMÉRICAS DO PRÓ-FÁRMACO ANTI-HCV SOFOSBUVIR
Bolsista: JULIA BAHIENSE DE SOUZA
Orientador(a): LUCAS VILLAS BOAS HOELZ
Resumo: Este projeto propõe a utilização de técnicas computacionais para a investigação do comportamento estrutural e dinâmico da enzima RNA polimerase (NS5) do vírus Zika (ZIKV), tanto em sua forma apo quanto complexada com as formas tautoméricas do metabólito ativo do pró-fármaco SFV (TSFV1-3). Assim, espera-se que essas análises ajudem na obtenção de informações, em escala atômico-molecular, sobre a estrutura e o comportamento dinâmico da RNA polimerase de ZIKV, incluindo a influência das formas tautoméricas do metabólito ativo do SFV na inibição dessa enzima, que parece ser um importante alvo terapêutico para tratar infecção por ZIKV.
Página 8 de 46 páginas.